Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BGNP21810 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BGNP21810 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BGNP21810 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BGNP21810 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BGNP21810 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms