Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT1P21579 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT1P21579 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT1P21579 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms