Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms