Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4AP20648 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms