Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms