Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB6P18564 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms