Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTPS1P17812 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms