Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms