Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB4P16144 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms