Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRAFP15056 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRAFP15056 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRAFP15056 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRAFP15056 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms