Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT10P13645 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT10P13645 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT10P13645 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT10P13645 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms