Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms