Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK4P11802 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK4P11802 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK4P11802 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK4P11802 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK4P11802 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms