Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms