Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHOP08100 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHOP08100 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHOP08100 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHOP08100 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms