Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms