Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B1P05026 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B1P05026 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms