Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24AO95486 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24AO95486 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms