Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG7O95352 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG7O95352 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms