Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRATO95237 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRATO95237 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRATO95237 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms