Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms