Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms