Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCATO75600 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCATO75600 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCATO75600 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCATO75600 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCATO75600 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCATO75600 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCATO75600 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCATO75600 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms