Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms