Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSVO60911 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSVO60911 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSVO60911 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSVO60911 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms