Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PDE6DO43924 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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