Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms