Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDB2O43679 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms