Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXA3O43365 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms