Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF208O43345 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms