Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms