Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3AO14802 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms