Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms