Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms