Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNRNPCL3B7ZW38 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms