Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms