Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A4D1N5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
A4D1N5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms