Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A3GALT2U3KPV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms