Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E1Q9Y466 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms