Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXOSC1Q9Y3B2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms