Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED5Q9Y3A6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMED5Q9Y3A6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED5Q9Y3A6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms