Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D4Q9Y2X8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D4Q9Y2X8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms