Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC3AQ9Y2H6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC3AQ9Y2H6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC3AQ9Y2H6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3AQ9Y2H6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC3AQ9Y2H6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms