Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A6Q9Y289 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A6Q9Y289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A6Q9Y289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms