Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN11Q9UMQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN11Q9UMQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms