Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP45Q9UL16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP45Q9UL16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms