Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3Q9UKS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3Q9UKS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms