Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA2Q9UJY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA2Q9UJY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA2Q9UJY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA2Q9UJY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms