Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms