Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRF1LQ9UGC7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms